Структура филиала включает в свой состав 2 кафедры и отделение «Среднего профессионального обучения».
Кафедра «Юридических дисциплин» является одним из структурных подразделений филиала СПбГЭУ в г. Кизляре. Кафедра была создана в 2020 г. Кафедру возглавляет к.и.н., доцент, заслуженный юрист РД — Сулейманов Б.Б. На кафедре работает высококвалифицированный и опытный профессорско-преподавательский состав.
Кафедра «Экономических дисциплин» является одним из структурных подразделений филиала СПбГЭУ в г. Кизляре. Кафедра была создана в 2020 г. Кафедру возглавляет д.э.н., профессор – Алибеков Ш.И. Кафедра осуществляет подготовку специалистов в области бухгалтерского учета и финансов.
Отделение «Среднего профессионального обучения» — структурное подразделение филиала СПбГЭУ в г. Кизляре в рамках которого реализуются специальности среднего профессионального образования. Ежегодно отделение выпускает профессионалов по специальностям: Экономика и бухгалтерский учет (по отраслям) и программирование в компьютерных системах.
В современных реалиях отделение «СПО» благополучно влилось в структуру университета. За годы работы студенты успели показать свои навыки и умения на региональных и всероссийских конкурсах и чемпионатах профессионального мастерства.